SEISAN on Linux安裝筆記

SEISAN(SEISmic ANalysis system)是挪威的Bergen大學地科系所開發出來的一套完整地震分析程式組，套用目前IT的語言，他類似一套地震分析的framework；白話而言，SEISAN試圖包含所有地震學可能會用到的工具集於一身，裡面有focmec，有wkbj工具，有hyp(看起來像是hypoDD之類的重新定位程式)，可以分析數位或是類比的地震資料。(脫離地球物理領域太久，都不太知道如何介紹這個好程式了！)作者提供了所有平台的版本(FreeBSD或許可以用solaris的版本試著編譯)，包含Linux, Solaris, MacOSX(intel), MacOSX(ppc)以及windows版本，本文則是針對在linux的環境下編譯並設定的筆記。

1. 取得最新版本的SEISAN
請到ftp://ftp.geo.uib.no/pub/seismo/SOFTWARE/SEISAN/取得適合你平台的package來安裝，以32bits的linux為例，你應該要下載seisan_v9.0.1_linux_32bit.tar.gz這個檔案。
2. 安裝gfortran以及X11函式庫
Debian/Ubuntu系列：

aptitude install gfortran libX11-dev -y

Fedora/CentOS系列：

yum install gcc44-gfortran libX11-devel -y

OpenSuSE/SLES系列：

zypper in -y gcc-fortran xorg-x11-devel

3. 解壓縮檔案

有些科學家似乎連tar跟tar.gz都搞不清楚。這個下載完成的檔案，你看他的檔名是tar.gz，於是你認為他是一個tar+gzip的檔案。其實她只是一個tar的檔案：

file seisan_v9.0.1_linux_32bit.tar.gz

seisan_v9.0.1_linux_32bit.tar.gz: POSIX tar archive (GNU)
所以這壓根不是tar.gz，只是一個普通的tarball而已。真正的tar.gz其訊息應該是這樣：

file seisan_v9.0_linux_32bit.tar.gz

seisan_v9.0_linux_32bit.tar.gz: gzip compressed data, was "seisan_v9.0_linux_32bit.tar", from Unix, last modified: Tue Mar 1 16:52:15 2011
所以解不開或是解開後有錯誤訊息很正常，因為你被檔名誤導了。版本在9.0的時候還沒這麼荒誕的錯誤，如果不小心點真的會被搞死。
假設你要安裝seisan的目的地為/opt/SEISAN901:

mv seisan_v9.0.1_linux_32bit.tar.gz seisan_v9.0.1_linux_32bit.tar
sudo mkdir /opt/SEISAN901
sudo tar xvf seisan_v9.0.1_linux_32bit.tar -C /opt/SEISAN901

4. 修改COM/SEISAN.bash
修改下列變數：

export SEISARCH="gfortran"
export SEISAN_TOP="/opt/SEISAN_v901"
			

5. 修改~/.profile
新增兩行到~/.profile這個檔案(CentOS/Fedora則是~/.bash_profile)

export SEISAN="/opt/SEISAN901"
source /opt/SEISAN901/COM/SEISAN.bash

稍候會用到root身份編譯，因此先用root身份export SEISAN變數到環境變數裡：

sudo source /opt/SEISAN901/COM/SEISAN.bash

6. 修改PRO/Makefile
修改下列變數：


INSTALL_PRO_PATH = /opt/SEISAN901/PRO
xlink_gfortran = -lX11 -L/usr/lib/X11

7. 產生libmseed.a

cd /opt/SEISAN901/SUP
sudo tar zxvf libmseed-2.5.1.tar.gz -C ../LIB
cd ../LIB/libmseed
sudo make

8. 修改DAT/SEISAN.DEF
修改下列變數：

WAVEFORM_DIRS      Waveform drectory    /opt/SEISAN901/WOR/seisnet
TEXT_PRINT               Unix example   lpr -Plp1
INIT_IMGMAP_FILE         PC example     /opt/SEISAN901/DAT/IMGWORLD.gif
IMGMAP_PATH              PC example     /opt/SEISAN901/DAT/IMGMAP
INTERNET_BROWSER         Unix example   /usr/bin/google-chrome
ACROBAT_READER           Unix example   /usr/bin/acroread
HELP_DIR                 PC   example   /opt/SEISAN901/INF

9. 進行最後編譯
雖然9.0.1版在PRO目錄下已經有許多編譯好的binaries，不過由於作者在編譯時的環境跟我們的環境未必相同，因此容易遇到遺失libgfortran.so.1這類訊息，因此還是要自行重新編譯。先前的準備工作就是為了能夠成功編譯，快樂的開始吧！

sudo make all

此時可以檢查程式是否可以執行，試著輸入seigmt看看有沒有 Nordic input file這樣的訊息出現。如果還是command not found，請重新登入應該就可以了。

這些天才科學家能不能寫一個不需要修改這麼多設定的程式呢？

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